要解决应用程序的并行配置不正确的问题，可以采取以下措施：
1、检查程序的并行配置参数，包括线程数、核心数、任务分配策略等是否正确设置。
2、检查应用程序的代码是否支持并行化，是否存在数据竞争等并发问题。如果存在问题，需要进行相应的代码修改或并发控制。
3、检查系统资源是否足够支持程序的并行配置。包括内存、CPU、网络带宽等系统资源。
4、使用性能分析工具对程序进行分析，找出瓶颈和性能问题，进一步优化并行配置。
5、如果以上措施都无法解决问题，可以考虑使用更高级别的并行化工具和框架，例如MPI、OpenMP、CUDA等。这些工具可以提供更高效的并行化支持，但需要更深入的专业知识和技能。